Первый деревянный храм в честь Вознесения Господня был п В 1990-е годы было проведено благоустройство прилегающей к собору территории: построена часовня во имя Всех Святых, в земле Сибирской просиявших (1996 год) и административный корпус (1998 год). В 1999 году, к празднованию 75-летия Новосибирской епархии, был отреставрирован и заново вызолочен главный иконостас собора. В 2011 году было выполнено поновление росписей и реставрация иконостасов Серафостроен в городе Новониколаевске в 1913 году.