По народному преданию,монастырь получил свое название по имени горы,которую местные жители называли Гандзасар,из-за серебряных рудников в ней (по-армянски гандз–сокровище,сар–гора).Гандзасар впервые упоминается армянским католикосом Ананием Мокаци в середине X в.Новый,известный в настоящее время храм, построен князем Гасан-Джалал Дола «мужем благочестивым,богобоязненным и скромным, армянином по происхождению» на месте старого храма, упоминаемого в Х в.,и торжественно освящен 22 июля 1240 г.